Hm, sowas macht nur Sinn, wenn du auf C: ein anderes Datei-System und auch ein anderes OS (z.B. Win2000/XP oder Linux) hast.
Entweder mußt du Win98 auf C: machen und das andere OS auf D: oder du probierst mit Partition Magic D: als primäres Laufwerk zu formatieren und dann C: verstecken. Dann müßte eine Installation klappen, danach C: wieder freigeben und mit dem OS auf C: ein Bootmenü erstellen.
Hab das so zwar noch nicht ausprobiert, aber vielleicht gehts ja.